硅藻土因其独特的理化性质，已经被广泛用作助滤剂、功能填料、催化剂载体、农药和肥料载体、保温隔热材料、吸附剂以及漂白材料等。
1硅藻土由于其很强的吸附能力而在食品工业中用作助滤剂起到除菌、除杂质、除异味的作用。如在酿酒过程中使用硅藻土过滤可以不断更新滤床，过滤速度快，产量大；表面积大，吸附能力强，能滤除0.1~1.0um的微粒，降低酒损1.4%左右，改善生产操作条件。硅藻土过滤器能更好的提高游泳池循环水处理出水水质，并能够在游泳池运行管理中节水、节电。其次硅藻土在食用油、医药口服液等方面也得到广泛的应用。
2硅藻土由于其化学性质稳定，吸附能力强，过滤性能良好，不溶于任何强酸，在废水处理中得到广泛的应用。利用硅藻土絮凝沉淀法对垃圾渗滤液进行预处理，可以初步降低渗滤液中的CODCr和BOD5,去除SS等污染物，从而可改善其生化性、降低负荷，为后续生化处理正常运行创造良好条件。
3硅藻土可以制成内墙涂料，其特点是墙面不反光，室内光线柔和，日本人将涂有硅藻土的墙纸称之为“可呼吸的墙壁”。硅藻土用于外墙涂料的应用也在发展，其前景广阔。此外，硅藻土在树脂、橡胶、造纸、混凝土、水泥填料和各种装饰保温隔热涂料领域也有广泛应用。硅藻土是很重要的一种催化剂载体，它广泛地应用在氧化、还原、加氢、脱氢、水合、聚合、转化、合成、烷基化、脱硫等各类反应中。从使用面看，用于有机化学反应较多；但从消耗量上统计，则主要用于制造钒催化剂载体、镍催化剂载体和TiO2载体。